Vsebina

• Glavna razlika
• Encimi za omejevanje tipa I
• Encimi za omejevanje tipa II
• Ključne razlike

Glavna razlika

Glavna razlika med restrikcijskimi encimi tipa I in tipa II je, da so restriktivni encimi tipa I v primerjavi z restriktivnimi encimi tipa II zelo zapleteni, poleg tega pa restrikcijski encimi tipa I so sestavljeni iz treh neidentičnih podenot. Medtem ko so po drugi strani restrikcijski encimi tipa II sestavljeni iz dveh enakih podenot. Nukleozi, ki se v notranjosti sekajo v DNK, so znani kot restrikcijski encim. Točka, ko ti restrikcijski encimi režejo sredino DNK, vendar ne na koncu. Za to lastnost restrikcijskih encimov so znani kot endonukleaze. Te omejitve imenujemo tudi molekularne škarje, molekularni noži, molekularni skalpeli ali restrikcijski encimi. Mesto prepoznavanja ali restrikcijsko mesto je območje, kjer ti restrikcijski encimi režejo DNK. To območje restrikcije ima vsaj 4-8 baznih parov. Obstajajo tri skupine teh restrikcijskih encimov, ki so naslednje:

• Endonukleaza tipa I restriktivna
• Endonukleaza tipa II restriktivna
• Restriktivna endonukleaza tipa III

Encimi za omejevanje tipa I

Encimi tipa I so več sub enot in so zapletena kombinacija modifikacijskih in restriktivnih encimov. Ti encimi režejo DNK naključno, vendar še zdaleč niso prepoznavni. Znano je bilo, da so ti encimi zelo redki, vendar smo po analizi sekvenciranih genomov ugotovili, da so pogosti. Restriktivni encimi tipa I ne povzročajo vzorčenja gelov ali diskretnih restrikcijskih fragmentov, zato se ne uporabljajo skoraj toliko kot encimi tipa II, vendar imajo poseben biokemični pomen.

Encimi za omejevanje tipa II

Omejevalni encimi tipa II na njihovem mestu prepoznavanja ali blizu njihovih mest za prepoznavanje na določenih položajih. Poleg tega izdelujejo tudi diskretne vzorce gelnega vezanja in diskretne fragmente. So veliko praktične vrednosti in se uporabljajo zelo pogosto. Široko so na voljo v prodaji. Večina teh encimov se veže na DNK kot homodimere in prepoznajo tudi sekvence DNK, ki so simetrične. Nekateri od teh restrikcijskih encimov prepoznajo tudi asimetrična zaporedja DNK, ker se vežejo kot heterodimeri. Nekateri encimi prepoznajo tudi sekvence, ki so neprekinjene. V zaporedjih tez sta dve polovici mesta sosednji s prepoznavnim zaporedjem. Nekateri od teh encimov prepoznajo tudi zaporedna zaporedja, v katerih se polovica mest loči drug od drugega. Cepitev, ki nastane v DNK, pusti 5 fosfata na eni strani in 3 hidroksila na drugi strani. Manjši so s podenotami, ki se gibljejo od približno 200 do 350. Najpogostejši encimi tipa II so tip IIS. Zunaj svojega mesta prepoznavanja se cepijo na eno stran. So normalne velikosti in prepoznajo zaporedja, ki so asimetrična in neprekinjena. Imata dve domeni, eno za DNK in drugo za cepitev DNK. Večinoma vežejo DNK kot monomere. Verige DNK, ki vsebujejo različna mesta prepoznavanja, so prepoznavni encimi tipa II na njih zelo aktivni. Druga vrsta encimov tipa II je tip IIG. Imajo restrikcijske in modifikacijske encime, poleg tega so veliki.

Ključne razlike

1. Restriktivni encimi tipa I so bolj zapleteni v primerjavi z restrikcijskimi encimi tipa II.
2. Encimi za prepoznavanje tipa I so sestavljeni iz treh neidentičnih podenot. Encimi za prepoznavanje tipa II so sestavljeni iz dveh enakih podenot.
3. Molekulska teža restriktivnih encimov tipa I je 400000 daltonov. Molekulska teža restriktivnih encimov tipa II je od 20.000 do 100000 daltonov.
4. Mesto rezanja restrikcijskih encimov tipa I je od mesta prepoznavanja oddaljeno 1000 nukleotidov. Mesto rezanja restrikcijskih encimov tipa II je na istem mestu prepoznavanja.
5. Zaporedje rezanja ni specifično za restrikcijske encime tipa I. Zaporedje rezanja je specifično za restrikcijske encime tipa II.
6. Encimi tipa I so odgovorni za zaščito DNK z metilacijo in encimi tipa II nimajo metilacijske aktivnosti.
7. Za aktiviranje encimov tipa I so potrebni ATP, Mg2 + in adenozil metionin. Za aktiviranje encimov tipa II je potreben le Mg2 +.
8. Encim tipa I ima aktivnost endonukleaze in metilaze. Tip II ima samo restriktivno aktivnost, nima endonukleaze ali metilalaze.
9. Encimi tipa I so bili identificirani pred encimi tipa II.
10. Tip I smo identificirali pri dveh različnih sevih E.Coli.
11. Primera encimov tipa I sta, Ecok in EcoB. Primera encimov tipa II sta Hind II in EcoRI.